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省特聘教授王伟团队在《Briefings in Bioinformatics》发表论文

发布时间:2017-05-12 15:29    浏览次数:
        近日,生命科学学院王伟教授科研团队在《Briefings in Bioinformatics》上在线发表题为“Subcellular locations of potential cell wall proteins in plants: predictors, databases and cross-referencing”的学术论文。《Briefings in Bioinformatics》是生物信息学和计算生物学的顶级期刊(JCR一区),2016年影响因子为8.399。该期刊由牛津大学出版社管理并出版。
        蛋白质的亚细胞定位是其功能行使的重要前提。准确地预测组学分析获得的大量蛋白质数据的定位信息吸引了来自数学、计算机和生物学等领域专家的高度关注。当前,对可能的植物细胞壁蛋白的定位分析、预测结果的可靠性及数据的交互印证,仍然缺乏系统的整合和权威的评价。鉴于此,王伟教授团队利用建立的拟南芥和水稻蛋白质数据库,详细地阐述了基于不同算法的16种预测工具的优劣性,整合了相关的网络蛋白质数据库,提出了从数据预测、交互印证到实验验证的细胞壁蛋白的综合分析策略,并利用定位和功能未知的200种玉米蛋白检验了上述策略的可行性,为发展更为准确的植物细胞壁蛋白的预测分析方法提供了新思路,对植物基因和蛋白质的功能注释研究具有重要意义。
        吴晓林博士为论文第一作者,博士生张沁斌、硕士生吴兆昆和邰付菊副教授为论文合作者,王伟教授为通讯作者。生命科学学院和小麦玉米作物学国家重点实验室为论文通讯作者单位。
        全文链接:https://doi.org/10.1093/bib/bbx050


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